Το 2002 μεταφέρθηκαν στον Δήμο οι αρμοδιότητες του Λιμενικού Ταμείου Ν. Κυκλάδων που αφορούν τον Δήμο Mήλου και συστήθηκε Ν.Π.Δ.Δ με την επωνυμία «Δημοτικό Λιμενικό Ταμείο Μήλου», το οποίο λειτουργεί σύμφωνα με τις διατάξεις του Π.Δ./τος 410/95 (Α, 231) και ασκεί τις αρμοδιότητες σύμφωνα με τις διατάξεις των παρ. 1 και 2 του άρθρου 28 του Ν. 2738/99, όπως ισχύει. (10 Σεπτεμβρίου 2002, ΦΕΚ Α 217/ 18-9-02)

Με αυτήν την κίνηση μεταφοράς αρμοδιοτήτων, το Δημοτικό Λιμενικό Ταμείο Μήλου καλείται να προσφέρει υπηρεσίες κοινής ωφελείας και να συμβάλλει στην εμπορική, επιβατική, ναυτιλιακή, τουριστική και αλιευτική κίνηση και γενικότερα στην εύρυθμη λειτουργία των λιμανιών του νησιού. (Αδάμαντας, Κάναβα, Πολλώνια).